標題	計劃年度
觀賞魚之分子育種技術研發:抗溫度逆境品系的篩選	2010
澎湖寒害對漁業之衝擊後續監測及預警體制之建立	2009
台灣沿海及離島地區海洋生物多樣性時空分布資料庫之建置與整合	2009
定置網漁場生物多樣性及其豐度變動之研究	2009
蘭嶼綠島漁業活動及漁業資源調查研究	2009
人工魚礁漁業效益調查研究	2009
候變遷對仔稚魚資源影響之研究	2009
氣候變遷對臺灣週邊海域基礎生產力影響監測	2009
漁船溫室氣體排放長期監測及資料收集	2009
養殖牡蠣之疾病因子監測	2009
台灣西部海域牡蠣養殖區環境監測與預警機制之研究	2009
強化漁會組織管理資訊整合與安全管理之應用	2009
非可沉式箱網設施技術	2009
養殖池自動化清淤機的商品化研發與應用試驗	2009
水產貿易圈之形成與流通途徑及運作研究	2009
中國大陸漁業生產結構對兩岸水產經貿交流的影響及因應對策之研究	2009
加強國際漁產貿易管理與諮商之研究	2009
都會區消費地魚市場多元化經營之研究	2009
休閒漁業與漁村發展參與決策模式之研究	2009
漁民投保勞工保險薪資認定作業機制之研究	2009