標題	修改時間
一百噸以上漁船赴三大洋從事捕撈鮪類及類鮪類作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-12-26
臺灣水產品生產追溯管理作業規範	106-12-22
即日起恢復漁船船主新僱用大陸船員，有關漁船員嚴重急性呼吸道症候群防疫工作應依公告事項辦理（停止適用）	106-12-15
臺灣地區漁船船主境外僱用大陸地區漁船船員搭乘直航客船及接駁管理措施	106-12-14
公告臺南縣將軍漁港劃設安置大陸船員暫置碼頭區、水域範圍，並自即日起實施（廢止）	106-12-11
輸入幼鰻檢驗要點	106-11-24
大陸船員暫置區域劃設執行要點	106-11-16
漁船申請兼營秋刀魚棒受網漁業執照，應由本會漁業署派員查驗秋刀魚棒受網漁撈設備（廢止）	106-07-28
兼營秋刀魚棒受網漁船每年漁季作業期間透過漁船監控系統，自動回報船位紀錄中斷日數累計達二十日，不得申領次年作業證明書，但已依漁業法核處罰鍰並執行完畢者，得申領赴北太平洋國外基地作業證明書（廢止）	106-07-28
赴西南大西洋海域魷釣漁船及運搬船請領作業證明書相關規定（廢止）	106-07-14
魷釣漁船及漁業專用漁獲物運搬船赴大陸地區港口卸售漁獲物應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-14
申請及核發輸韓國秋刀魚漁獲證明書作業要點（廢止）	106-07-14
一百零二年度漁船赴三大洋從事南方黑鮪作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-14
一百零一年度漁船赴三大洋海域從事南方黑鮪作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-14
南方黑鮪產地漁業證明書有效期限為四個月（廢止）	106-07-14
國外基地作業或參加國外漁業合作漁船申請核發黑鮪漁獲證明書作業規定（廢止）	106-07-14
南方黑鮪漁業證明書（CCSBT SOUTHERN BLUEFIN TUNA CATCH DOCUMENT）申請核發作業要點（廢止）	106-07-14
一百年度我國漁船赴三大洋海域從事南方黑鮪作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-07-14
我國漁船不得在公海捕撈或持有鮭鱒魚，非經中央主管機關核准不得在他國經濟海域捕撈鮭鱒魚漁業合作（停止適用）	106-07-11
公告太平洋禁止作業水域（停止適用）	106-07-11