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九十二年赴大西洋從事捕撈鮪旗魚類漁船及漁獲物運搬船作業應行遵守及注意事項第四點、第五點有關大目鮪組大目鮪、北大西洋長鰭鮪組長鰭鮪漁獲限額分配情形如下（廢止）	106-06-19
於太平洋、印度洋及大西洋之一百噸以上從事延繩釣漁業之漁船，自九十三年一月一日起暫停受理轉換作業洋區之申請（廢止）	106-06-19
九十三年赴大西洋從事捕撈鮪旗魚類及漁獲物運搬船作業應行遵守及注意事項第七點有關意外漁獲劍旗魚、黑皮旗魚及紅肉旗魚之單船漁獲限額如次（廢止）	106-06-19
一百噸以上延繩釣漁船及漁獲物運搬船赴印度洋從事鮪旗魚類作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-06-19
赴南緯二十八度以南水域作業延繩釣漁船裝設避鳥繩規定（廢止）	106-06-19
赴印度洋或中西太平洋水域作業二十噸以上未滿一百噸延繩釣漁船互換水域作業輔導措施（廢止）	106-06-19
二十噸以上未滿一百噸延繩釣漁船登記赴印度洋作業措施（廢止）	106-06-19
二十噸以上未滿一百噸延繩釣漁船登記赴東太平洋作業要點（廢止）	106-06-19
九十九年度一百噸以上漁船赴印度洋從事捕撈鮪旗魚類作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-06-19
遠洋鮪延繩釣漁船及漁獲物運搬船赴三大洋從事轉載漁獲物作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-06-19
一百年度我國鮪延繩釣漁船赴大西洋作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-06-19
一百年度一百噸以上漁船赴印度洋從事捕撈鮪類及類鮪類作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-06-19
一百年度一百噸以上漁船赴太平洋從事捕撈鮪類及類鮪類作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-06-19
遠洋鮪延繩釣漁船海上轉載區域觀察員輔導措施（廢止）	106-06-19
海宴精緻漁產品證明標章規定事項（廢止）	106-06-15
廠商申請ＣＡＳ優良農產品證明標章（水產品類）認定評審規定及ＣＡＳ優良農產品證明標章（水產品類）品質規格及標示規定（廢止）	106-06-15
公告「大陸船員接駁漁船應安裝之船位回報器廠牌型號、機型及安裝規格」（廢止）	106-06-03
指定財團法人中國驗船中心為暫置大陸船員漁船之驗船機構（停止適用）	106-06-03
公告臺灣鯛、海鱺、鰻魚、鱸魚、虱目魚、石斑、文蛤、蜆、牡蠣及白蝦等１０種水產品之臺灣良好農業規範（ＴＧＡＰ）作業相關圖表(全部停止適用)	106-06-03
修正公告「白蝦」及「黃臘鰺」水產品之「臺灣良好農業規範（TGAP）」作業相關圖表(全部停止適用)	106-05-25