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一百年度一百噸以上漁船赴印度洋從事捕撈鮪類及類鮪類作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-06-19
一百年度一百噸以上漁船赴太平洋從事捕撈鮪類及類鮪類作業應行遵守及注意事項（廢止）	106-06-19
遠洋鮪延繩釣漁船海上轉載區域觀察員輔導措施（廢止）	106-06-19
海宴精緻漁產品證明標章規定事項（廢止）	106-06-15
廠商申請ＣＡＳ優良農產品證明標章（水產品類）認定評審規定及ＣＡＳ優良農產品證明標章（水產品類）品質規格及標示規定（廢止）	106-06-15
公告「大陸船員接駁漁船應安裝之船位回報器廠牌型號、機型及安裝規格」（廢止）	106-06-03
指定財團法人中國驗船中心為暫置大陸船員漁船之驗船機構（停止適用）	106-06-03
公告臺灣鯛、海鱺、鰻魚、鱸魚、虱目魚、石斑、文蛤、蜆、牡蠣及白蝦等１０種水產品之臺灣良好農業規範（ＴＧＡＰ）作業相關圖表(全部停止適用)	106-06-03
修正公告「白蝦」及「黃臘鰺」水產品之「臺灣良好農業規範（TGAP）」作業相關圖表(全部停止適用)	106-05-25
動力漁船赴台日漁業協議適用海域作業投保漁船船主責任險補助要點	106-05-02
公告香魚、烏魚、黃臘鰺及淡水長臂大蝦等４種水產品之「臺灣良好農業規範（ＴＧＡＰ）」作業相關圖表（全部停止適用）	106-05-02
核釋漁船船員管理規則第十五條附表三	106-05-01
沿近海漁船捕撈鯊魚限制事項（廢止）	106-04-06
輸歐盟漁產品養殖場登錄管理作業要點	106-02-14
未滿一百噸赴太平洋印度洋從事捕撈鮪類及類鮪類作業漁船電子回報漁獲資料輔導措施（廢止）	105-12-19
輸歐盟水產飼料加工廠登錄管理作業要點	105-10-26
未滿一百噸漁船赴太平洋印度洋從事捕撈鮪類及類鮪類作業應行遵守及注意事項	105-08-23
核釋漁船船員管理規則第十七條及第十七條之一規定	105-08-16
優良水產養殖場作業基準（廢止）	104-12-18
優良水產養殖場認證管理作業要點（廢止）	104-12-18