標題	計劃年度
水產飼料品質(黴菌毒素,重金屬)管理及研究計畫	2008
水產養殖用藥檢測技術研發應用	2008
建立魚蝦貝類疾病防治技術	2008
生態養殖結合產銷履歷經營管理模式之研究	2008
建立生態養殖生產技術規範	2008
提升幼生階段牡蠣附苗率之生產技術研究	2008
人工微粒飼料替代餌料生物之開發與應用	2008
餌料生物生產供應鏈建立與應用	2008
重要養殖種類無特定病原(SPF)水產種苗之生產技術之開發與應用(2)	2008
重要養殖種類無特定病原(SPF)水產種苗之生產技術之開發與應用(1)	2008
遠洋漁業混獲物種保育及管理之國際趨勢分析	2008
以即時聚合連鎖反應快速鑑定鮪魚之技術開發	2008
海洋環境(氣候)變異對鮪漁況與資源影響之研究	2008
太平洋、大西洋及印度洋鯊魚混獲量及資源指標之估計	2008
魷魚及秋刀魚的資源動態研究	2008
三大洋產長鰭鮪資源漁業生物學特徵參數及其評估之研究 (一)	2008
三大洋旗魚類正鰹及南方黑鮪資源研究	2008
三大洋熱帶鮪類與黑鮪資源指標與資源狀態評估研究 (一)	2008
臺灣漁業科技追求卓越之規劃研究-海洋漁業政策之規劃	2008
建立海洋生態標籤認證及選擇機制之研究	2008