標題	計劃年度
台灣周邊海域三棘鱟之保育及管理研究	2008
台灣沿近海小型鯊魚資源之調查及評估 (3)	2008
籠具漁業對底棲生物資源之影響及因應措施之研究	2008
寶石珊瑚漁業作業動態之調查研究	2008
臺灣沿近海域火誘網漁業資源之調查評估	2008
評估?鱙漁業指定性休漁之效益，漁撈作業方式效益及混獲特性研究	2008
臺灣東北部海域與日本重疊水域之臺灣漁船漁業資源利用現況之研究	2008
臺灣近海白皮旗魚資源研究	2008
臺灣東部翻車魚資源調查及洄游路徑研究	2008
臺灣周邊海域花腹鯖之資源評估	2008
臺灣周邊海域?鱙資源管理及混獲經濟性仔稚魚對其資源量之影響	2008
魚苗放流後之成長、存活率與放流效益之評估	2008
臺北縣員山子海域環境監測及珊瑚（礁）生態系變動之調查研究	2008
以基礎生產力評估過漁指標之研究	2008
台灣沿海及離島地區海洋生物多樣性時空分布資料庫之建置與整合 (IV)	2008
台灣經濟性魚類生命條碼資料庫之建置	2008
台灣海域珊瑚礁分布及珊瑚多樣性調查研究 Ⅳ	2008
綠島及蘭嶼海洋生物多樣性及漁業資源永續利用之研究	2008
小琉球海域生物多樣性及漁業資源永續利用之研究	2008
澎湖本島海域不同棲地環境之生物多樣性調查研究 (二)	2008