標題	計劃年度
養殖天然災害通報E化與動態生產資料建置	2006
運用漁業商業智慧模式-建構優質安全漁產品產銷資訊體系	2006
建構優質安全漁產品產銷履歷系統	2006
臺灣蜆節水養殖技術之研究	2006
活魚運輸設備之研發	2006
立體式養殖系統研發與應用	2006
增進魚類環境適應能力之研究	2006
增進魚類低溫適應能力之研究	2006
建立基因標記以區別不同品種吳郭魚	2006
錦鯉間質性腎炎及鰓壞死病毒疫苗之研發與應用	2006
漁民福利需求措施與法規之研究-本國與西歐國家漁民福利差異研究	2006
魚貨批發市場職能再造與調整策略方向之研究	2006
健康及安全養殖漁產品垂直統合經營之研究	2006
加入WTO後我國大宗水產品進口與關稅調降後之衝擊影響評估	2006
台灣漁業產業政策及經濟分析之研究	2006
兩岸漁產品商標註冊法規分析與申請標準作業流程建立之研究	2006
輔導水產品及其加工產品之標示管理規範及對策評估之研究	2006
全面推動水產品產銷履歷體系之對策評估	2006
建立我國水產品產銷履歷體系相關規範之研究	2006
影響優質魚食推廣相關影響因子調查評估之研究	2006