標題	計劃年度
南方黑鮪及太平洋黑鮪漁獲年齡組成暨成長研究 (101)	2012
印度洋紅肉旗魚、黑皮旗魚及南方黑鮪CPUE標準化暨資源研究 (101)	2012
太平洋黑皮旗魚及北太平洋與大西洋紅肉旗魚CPUE標準化暨資源研究 (101)	2012
中西太平洋熱帶鮪類（大目鮪及黃鰭鮪）鮪釣歷史資料檢視暨CPUE標準化研究 (101)	2012
印度洋熱帶鮪類(大目鮪及黃鰭鮪)資源研究(CPUE標準化) (101)	2012
大西洋熱帶鮪類(大目鮪及黃鰭鮪)資源研究與太平洋黑鮪資源研究 (101)	2012
北方三島海洋生物多樣性及漁業資源永續利用之研究 (100)	2011
漁業資源保育區及稀有物種之調查及規劃 (100)	2011
臺灣沿海及離島地區海洋生物多樣性時空分布資料庫之建置整合與推廣應用 (100)	2011
人工魚礁漁業效益調查及可行性評估 (100)	2011
氣候變遷對漁業之影響研究—臺灣周邊海域因氣候變遷流系消長對重要經濟性魚種漁業資源變動影響之研究 (100)	2011
澎湖箱網養殖區環境因子監測 (100)	2011
100年度「漁業產銷戰情決策與資訊整合服務」 (100)	2011
自動巡弋立體增氧機的商品化與推廣試驗 (100)	2011
石斑魚工廠化養殖系統關鍵技術的研發與商品化 (100)	2011
「東協加三」水產品產銷結構與我國水產品貿易管理之分析研究 (100)	2011
日本漁業所得補貼之政策意涵研究 (100)	2011
漁業產業政策及國際化發展分析與前瞻研究-華盛頓公約(CITES)及生物多樣性公約(CBD)對水生動植物及海洋生物多樣性保育議題之發展趨勢及因應對策 (100)	2011
我國水產品糧食安全需求之研究 (100)	2011
參與國際漁業組織研究 (100)	2011