利用漁港內現有之水域，重新分配港內泊區，興建浮動碼頭部分，以促進漁港澳資源共享，並打造遊艇專業停泊區和示範級的休閒遊艇碼頭，改造傳統漁港，成為兼具漁業和休閒觀光的現代化漁港，創造臺灣漁港的新風貌。

漁港過去均以傳統漁業使用為主，近年來海岸及海上遊憩風氣盛行，漁港朝多功能利用發展。本署為實現馬總統政見，執行振興經濟擴大公共建設投資－海岸新生及漁業建設計畫，以「腹地規模」、「漁港週邊遊憩活動發展條件」、「水域環境」、「陸上腹地寬廣」，「交通便利且鄰近都會區」等條件，篩選擇定基隆八斗子漁港、宜蘭烏石漁港、台南安平漁港等3處漁港，利用港內現有之水域，重新分配港內泊區，興建浮動碼頭，打造遊艇專業停泊區和示範級的休閒遊艇碼頭，其中八斗子漁港可提供50個新建船席位，其中 100ft遊艇7席、60ft遊艇13席、50 ft遊艇30席，安平漁港可提供60ft遊艇 8席、48ft遊艇24席，烏石漁港可提供60ft遊艇4席、48ft遊艇13船席、30ft遊艇15船席，總共增加提供114船席泊位。八斗子漁港、安平漁港及烏石漁港已分別於101年9月21日、102年2月1日及102年6月23日啟用。

另為與國際接軌，行政院農業委員會參考國內外遊艇碼頭案例，重新檢討收費標準，訂定「第一類漁港遊艇碼頭停泊費收費標準」，改以船席長度及遊艇長度計費，經行政院農業委員會於104年5月14日訂定發布施行，同時對於已完成委託營運（OT）之八斗子漁港碧砂遊艇碼頭，經營業者表示亦配合以長度計算停泊費。