一、查核作業漁船船長所填載（報）之資料是否真實。

二、查核作業漁船是否依照本會所規定之作業管理規定作業。

三、執行本會指示蒐集資料及採取生物體標本。

四、依本會指定之時間與方式回報相關資料；遇有緊急情事，應立即回報。

五、其他經本會以書面指定與執行觀察員任務有關之事項。

一、漁業人應於漁船預定進港或出港前七日以書面通知本會漁業署。

二、依本會漁業署通知之時間及地點，接載及送返觀察員執行第三條所定之任務。

三、提供觀察員相當於幹部船員之生活照顧、醫療與待遇。

四、其他應指示作業漁船船長及船員遵行之事項。

１、船長應參加本會辦理之航前講習。

２、於觀察員登船時，船長應向觀察員說明漁船之作息方式、安全維護及漁船設施，並將觀察員上船執行任務之事實，通報全船人員知悉。

３、每日應提供漁獲報表供觀察員查核並簽署。

４、每週應提供當週魚艙裝載魚貨記錄供觀察員查核。

５、應遵守相關作業規定，並接受觀察員指揮，丟棄及記錄不得捕撈或持有之魚種。

６、提供並協助觀察員獨立使用衛星電話、傳真機、網際網路、單邊帶無線電話（ＳＳＢ）等通訊設備。

７、不得妨礙觀察員紀錄漁船航行儀器相關資訊。

８、協助蒐集觀察員指定之漁獲物及意外捕獲之生物體。

９、提供觀察員在作業漁船上生活與執行任務所需之空間、設備與資料，並於觀察員執行任務時，為必要及充分之協助。

10、提供適當存放觀察員執行任務所得資料與樣品之處所。

11、為觀察任務需要，不得拒絕或妨礙觀察員就觀察任務有關事項所為詢問及作成紀錄。

12、簽署觀察員執行任務所得之資料或所作之紀錄，如對紀錄內容有不同意見時，得附記其意見。

13、漁船船長應確保觀察員安全，漁船遇有緊急危難時，應予特別照護及給予避難協助。