冬季期間常有寒流侵襲，對於不適合冬季養殖之熱帶魚種（如虱目魚、吳郭魚等），政府並不鼓勵於冬季養殖，以避免寒冬侵襲造成損失。惟部分漁友仍從事養殖，應自行評估越冬風險，確實加強越冬設備及管理措施，以避免寒害損失。

提供養殖漁民在冬季期間，從事養殖應加強防寒措施如下：

一、於魚塭北側搭蓋防風棚，且棚蓋與水面之角度應小於30度，並加強越冬溝之保溫、防寒及加溫等設備。

二、放養數量：因環境、條件、種類而異，越冬溝內之密度以虱目魚在每立方公尺1.3公斤以下為宜。

三、寒流來襲時，儘量避免有驚動魚塭內魚群之行為，例如：投餌、換水及無謂地開關水車。

四、投餌料：在氣溫回升、暖和之日，方可依情況酌投飼料。

五、為避免因擾動水體，致水溫下降。

六、寒流來襲後，浮於水面之魚體須馬上撿除，防止水質惡化。

七、寒流侵襲或停滯時，應注意水溫降低之速度，水溫若低於15℃時，應採緊急措施，如加溫以提高水溫，俾減輕死亡。