針對4月30日晚上發生台中市梧棲籍「全吉慶326號(CT3-4095)」遭日本水產廳公務船緊追並發射漆彈案，漁業署表示，全吉慶326號漁船係在日本與那國島北方14浬處作業遭日本水產廳公務船發現，該地點已超出台日協議水域外8浬，且該船未申請台日漁業作業許可亦未按時回報漁船船位，該署於該船進港時已訪談船長並於檢視相關事證後，該船明顯違反漁業法相關規定，將本著護漁不護短的原則，予以嚴懲。
海巡接獲通報  即時護漁 
漁業署說明，「全」船於本(103)年4月30日19時許，於北緯24度42分、東經123度5分處（台日協議水域外約8浬）遭日本水產廳公務船緊追，該船拒絕接受登檢，加速返航，並通報漁業電台轉通報海巡署協助護漁。我海巡署「謀星艦」在20時18分與「全」船會合，並護送該船返航。當時該船已進入我暫定執法線內，日方雖要求「全」船應由其帶返調查，我漁業署透過外交部與駐日代表處多次向日方交涉，表達該船由台方帶回並詳加調查，如確有違規會予嚴懲之立場，日方兩艘公務船爰於當日23時56分，停止緊追調頭回航。
漁船確屬違規  決不護短予以嚴懲
漁業署進一步指出，台日漁業協議於去（102）年4月10日簽訂後，歷經三次臺日漁業委員會的討論，雙方並於本（103）年1月24日完成協商訂定「臺日漁業協議」適用海域漁船作業規則，我國並於3月5日發布「延繩釣漁船赴台日漁業協議適用海域作業管理辦法」，規範延繩釣應行遵守相關事項。惟查「全」船總噸位約為34，屬總噸位20以上之延繩釣漁船，依規定要裝設船位回報器（VMS），維持通訊正常，且赴台日水域應申請許可；惟該船VMS斷訊且未申請台日作業許可，該船於5月1日7時許進南方澳漁港，漁業署於會同海巡署進行調查後，確實有越界作業及違反船位回報等情事，將依法懲處。
日本已加強取締工作，漁民作業請務必遵守規定
漁業署最後指出，日方因應琉球漁民要求，已增派10艘取締船在協議適用海域外之水域加強取締工作，該署再次呼籲漁民朋友，在海上作業務必遵守臺日漁業協議範圍或維持在暫定執法線內，避免遭日方取締。對於刻意關閉船位訊號或違規越界捕魚的船隻，漁業署也將依法處罰，視情節輕重依漁業法規定處以罰鍰、扣照或撤照之處分，呼籲漁民朋友應確實遵守作業規範。

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