漁業署指出，石斑魚銷售以大陸市場為主，以往僅能銷往香港後再轉運大陸，伴隨政府開放活魚運搬船直航大陸，雖已大幅擴大外銷數量，但仍面臨銷售大陸水產品需要10.5％關稅之成本影響，故石斑魚列入早收清單後，得以免除關稅，可降低產銷成本，提升產業競爭力，並有助於大陸市場開拓，進而帶動市場擴展。部分媒體引述屏東縣曹縣長批評對產業毫無實質助益，顯與事實不符。

　　漁業署表示，活魚運搬船開放直航至大陸福建省東山銅陵等11處港口，銷售範圍已可涵蓋大陸華南地區之重要城市，運搬時間(以上海為例）可由48小時縮短至21小時，運搬成本由122-130萬元減少至90萬元，魚體耗損率由10%降低至5%，從而我活石斑魚外銷需求及競爭力大增，近期更因世博因素，台灣漁民之活石斑池邊交貨魚價已大幅自每公斤250元漲至400元以上，今後如再加上兩岸經濟合作協議（ECFA）將石斑魚列入早收清單而免除關稅，將可進一步降低成本，對大陸市場之開拓更為有利，對運銷商及養殖漁民更是直接受惠。

　　漁業署最後表示，石斑魚已列入精緻農業發展方案，政府積極辦理石斑魚產值倍增計畫，伴隨兩岸簽訂ECFA，有助於石斑魚產業的長期發展；此外ECFA的簽訂不僅石斑魚產業受益，同時列入早收清單之烏魚、秋刀魚、虱目魚、生鮮甲魚蛋等水產品將一同受惠，零關稅有助大陸市場開拓及提高漁民收益。