從人類開始利用船隻運輸以來，海盜便應運而生，特別是航海發達的16世紀後，只要是商業發達的沿海地帶就會有海盜活動。位於馬來半島與蘇門答臘島之間的麻六甲海峽，曾經是近代海盜出沒最多的海域，但近年索馬利亞附近的印度洋海域海盜猖獗，依據聯合國國際海事局（IMB）最新統計資料顯示，從2008年到2012年海盜行為及武裝攻擊船舶事件總共發生約1,884次，其中有759件發生在印度洋亞丁灣及索馬利亞海域，該海域已成為目前海盜活動風險最高的區域之一。

2009年至2010年間，我國有7艘漁船在航經麻六甲海峽時遭受攻擊或搶劫，但多成功加速脫逃或支付少數金額後盜匪即離去，並未發生挾持船舶事件。但在印度洋海域，自2005年迄今，我國有10艘漁船遭索馬利亞海盜劫持，多數遭挾持漁船是在船東支付高額贖金後才被釋放。

為因應印度洋海盜問題，漁業署採取若干預防海盜措施，包括：
一、船隻勸導及管理。
二、加強船隻自我防衛措施。
三、與國際合作打擊海盜機制及援助我遭劫漁船。

目前多國聯合艦隊在索馬利亞附近海域的軍事行動，已初步得到減少海盜攻擊事件的效果，國際社會還需要共同努力協助索馬利亞等國家穩定其國內社會秩序，才能期望海盜問題獲得緩解。