從水牛瘤胃微生物多源基因庫篩選新穎脂解酵素基因
- 期別
- 2012-45-3-265-274
- 作者
- 廖仁寶、陳若菁、吳明哲、李佳音、程梅萍
- 關鍵字
- 脂解酵素基因、多源基因庫、瘤胃微生物、水牛
- 摘要
- 本研究目的在以多源基因體學方式建構水牛瘤胃多源基因庫，再以功能導向的篩選方式分離出含有脂解活性的株系。水牛瘤胃中細菌之多樣性頗為豐富，以質體系統建構由水牛瘤胃液樣品萃取DNA之基因庫，利用活性篩選的方式，直接從基因庫中篩選出具脂解活性之株系4株，經DNA定序與比對後，此4株系的插入片段具有4個完整相對應脂解酵素基因的ORFs。且此4個預測的脂解蛋白質序列經與資料庫比對分析後，發現其相同性介於27–59%，依據Arpigny & Jaeger之細菌脂解酵素分類，其中EstR1屬於第七類，EstR3比較明顯屬於第八類，EstR4可能屬於第六類，而EstR2則可能成為新的類別。依據培養盤上之功能分析，此4個預測的脂解酵素應為酯酶而非脂肪酶，又以資料庫比對分析結果顯示，其中EstR1與EstR2可能另具有聚醣分解能力。