青蔥栽培生產期間易因高溫、高濕等環境而好發病蟲害，造成農友極大損失，因此栽培全期都必須做好田間管理工作。農業部臺中區農業改良場為推動化學農藥風險減半政策，建議蔥農導入病蟲害綜合管理(Intergrated Pest Management,IPM)策略，透過種苗預措消毒、耕地翻耕等預防性管理措施，同時利用黏蟲紙及田間目視的環境監測數據，精準用藥以防治病蟲害，可減少25%化學農藥使用量，並能生產品質優良且安全合格的青蔥。

臺中農改場表示，青蔥栽培全期可能遭遇薊馬、葉蟎、根蟎及甜菜夜蛾等害蟲，以及炭疽病、紫斑病、疫病及銹病等病害，若採行預防管理可大幅降低栽培初期的防治成本及損失風險，而預防管理措施包括：(1)選用健康種苗，可阻隔病害隨苗進入田區傳播;(2)種植前以化學藥劑對分株苗進行預措消毒，可降低種苗帶病、蟲發生率，增加種苗存活率;(3)水旱田輪作可有效消除病蟲害與雜草滋生，若連作栽培前田區，建議土壤進行翻耕曝曬處理，可降低根蟎與薊馬族群密度;(4)避免使用生雞糞當基肥，因未經發酵程序，直接施用至土壤易導致土壤養分不均、短期間土壤酸鹼值變化、鋅含量累積及蚊蠅孳生等問題；(5)田間使用夜蛾類性費洛蒙誘餌(甜菜夜蛾、斜紋夜蛾)，可降低夜蛾類害蟲的危害。

臺中農改場指出，預防管理措施應在栽培前就先規劃與執行，如夜蛾類區域共同防治應在栽培前2週設置完畢，種苗應在入苗前消毒完成；此外，青蔥栽培過程也須隨時監測病蟲害發生情形，可用黃色或藍色黏紙監測蟲害，同時目視觀察植株是否發生黃化、斑點、畸形等異狀，以掌握最佳防治時機。

臺中農改場說明，防治技術除了以化學藥劑外，青蔥採收期亦可使用蘇力菌、苦參鹼(防治鱗翅目蝶蛾類)、蓋棘木黴菌(防治疫病)、礦物油(防治葉蟎、薊馬類害蟲)、植物精油製品(防治葉蟎類害蟲)等安全資材，以降低化學農藥用量，同時避免病蟲產生抗藥性，確保青蔥安全性。該場綜整現有登記防治藥劑，掌握最佳防治時機，並落實預防管理措施，可大幅提高防治效率，達成農藥減量25%及安全生產的目標。

    臺中農改場強調，農友進行青蔥施藥時應確實使用已核准登記的藥劑，輪用藥劑與安全資材以維持防治效果，並遵守各藥劑的安全採收期。該場籲請農友依IPM策略進行全面檢視，做好預防、監測及防治三大面向的工作，方能有效降低病蟲害威脅，穩定安全生產與獲益。